Des fragments de vitraux du XVIe siècle sont dispersés dans des verrières recomposées de la nef ou des chapelles latérales (écus armoriés, anges, Dieu le père..). Dans les fenêtres hautes de l’abside subsistent des verrières des environs 1600, qui ont dû remplacer celles qui avaient été détruites quelques années auparavant lors des guerres de Religion ; la plupart ont été restaurées au XIXe siècle ; elles sont occupées par des figures de saints en pied, au milieu desquels prend place saint Maurice (baie axiale, à gauche).